碧云寺位于海淀区香山公园北侧，是一座依西山余脉聚宝山东麓山势而建的园林式寺庙。碧云寺创建于宁宗至顺二年（1331），距今已有600 余年的历史。明正德年间，御马监太监于经用贪污的赃款拓修碧云庵，并改名为碧云寺。明天启三年（1623），大宦官魏忠贤又大加修饰碧云寺。乾隆时期碧云寺进行了大规模的扩建，增建了金刚座宝塔，行宫和罗汉堂，整座寺院的格局业已成形。
碧云寺坐西朝东，依山势而建。现寺院总体建筑格局分南、中、北三路。中路建筑自东向西依次有山门殿、钟鼓楼、天王殿、大雄宝殿、菩萨殿、孙中山纪念堂、汉白玉牌坊、八角形碑亭、金刚宝座塔。寺院的南路建有大禅堂、五百罗汉堂，寺院的北路建有碧云寺行宫，行宫由涵碧斋、含青斋、水泉院、清净心等组成。中华民国时期，碧云寺被作为文化教育事业的重要场所使用。1925 年3 月，孙中山先生在北平逝世后，灵柩迁至碧云寺金刚宝座塔内保存。1929 年碧云寺内设立了“孙中山纪念堂”和“孙中山先生衣冠冢”。
1951 年，碧云寺被公布为北京市第一批文物保护单位。1952 年，北京市人民政府批准西山风景区管理所管理碧云寺，经过修整后，1954 年9 月碧云寺作为公园正式对外开放。
2001 年，被列入全国第五批重点文物保护单位。
