上方寺建于辽应历十年(960),曾叫妙峰寺,位于凤凰岭北线景区海波650多米的山上。据碑文考证,该寺从明代天顺至清朝道光的300余年中,为香火鼎盛时期,至清朝末期衰落。
原寺庙坐西朝东,有三重大殿,即天王殿、大雄宝殿、三圣殿,《昌平县志》有古诗描述上方寺“蜡履响空林,宵来草色侵。蹬盘千级险,寺隐一枝深。古貌僧初定,迥峰曰半险。流水生层底,谁不洗尘襟。”目前仅存五檐六角七层的玲珑塔一座,其上砖雕小佛、小塔,2003年对海淀区文化委对该塔进行了修复。另外,距上方寺东100米处有“应历十年十月六日”刻字,刻字石刻顶上有两个蓄水池,西侧有四个石槽及一口水井(距塔月100米)。另有古银杏树一株,残碑三块,大殿后有覆钵式花岗岩残塔一座。
1999年被公布为海淀区文物保护单位。